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遺傳流行病學(Genetic Epidemiology)
概念與方法
- 考量疾病病因時,除環境因子外,也必須納入遺傳易感性(genetic susceptibility)。
- 因分子與遺傳技術進步,流行病學研究已擴展到使用生物樣本。
- 2003 年 Human Genome Project 與 2005 年 International HapMap Project 完成後,研究者得以使用全基因組關聯研究(genome-wide association study, GWAS)。
- GWAS:檢視疾病與單核苷酸多型性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)之間的關聯;SNPs 是「一起以區塊(單套型 haplotypes)遺傳」的一群 DNA 變異的標記。
- 研究結果可用於探討疾病的分子路徑;關聯的尋找可採假說驅動或非假說驅動方式。
範例:圓禿(alopecia areata, AA)
- Petukhova 等以 GWAS 探討 AA 的致病機轉。
- 使用 1054 cases 與 3278 controls 的遺傳樣本,找出 139 個與 AA 顯著相關的 SNPs(P ≤ 5 × 10−,原文如此)。
- 這些 SNPs 與含有數個控制 T 細胞活化及細胞激素(cytokine)產生之基因的基因體區域相關。
- 結果指出先天性(innate)與後天性(acquired)免疫皆參與 AA 的致病機轉,並提示此病可能有自體免疫機制。